Macrogen可提供各种基因组分析服务,包括基于HiSeq X Ten平台的大规模全人类基因组测序服务,也被称为X-Genome (Xpressway to Genome)。作为Macrogen旗下子公司,Macrogen Corp (USA)目前依托其CLIA认证的临床实验室,为医师和患者提供基于临床测序的医疗服务。此外,Macrogen正在计划推出一项医疗信息与内容业务,而该业务将采用从Asian Genome Project(亚洲人基因计划)及其全球基因组网络所获取的基因组大数据。
Macrogen董事长兼创始人Jeong-Sun Seo博士表示:“在我们依托一系列NGS平台,具备每天生成500多千兆字节的NGS数据的能力同时,加快这种大数据的分析使我们能以最大容量经营NGS设施并进一步提升客户满意度。在对多个数据分析选择进行评估之后,我们认为DRAGEN具备节省大量时间的能力,同时可同步降低基础设施成本并保持较高精确性,这将成为努力推进个性化药物与基因组研究的客户的最佳解决方案。”
DRAGEN是全球首款专门用于分析NGS数据的处理器。该处理器在PCIe卡上集成,可安装在预配置服务器上,从而无缝化整合至生物信息工作流程。
Edico Genome首席执行官Pieter van Rooyen哲学博士则表示:“作为全球最大的测序中心之一和首家提供1000美元基因组服务的商业化机构,Macrogen是基因组学方面的真正领导者并不断为其客户提供最为尖端的技术。DRAGEN可专门用于处理由高吞吐量测序仪器生成的大数据,它处理时间快,具有成本效益并且精确度高。我们期待与Macrogen共同在多个中心部署DRAGEN,并且将Bio-IT处理器的各种好处提供给全球17000多位客户。”
DRAGEN近期采用全基因组测序,以创纪录的26个小时完成了对重症新生儿的分析,同时敏感度和特异性达99.5%,其成果发表在《Genome Medicine》上。自此之后,DRAGEN的Genome Pipeline可以进一步加速分析全基因组,从BCL到VCF仅需26分钟。
DRAGEN采用了现场可编程门阵列(FPGA),具有高度的可重组性,能够以加速硬件的方式部署基因组系列算法,例如BCL转化、压缩、绘图、调整、分类、重复标示和单体变异提醒。这种灵活的DRAGEN平台使Edico能开发定制化算法,以及改善并提升现有系列算法。如欲获取升级版,客户仅需远程下载即可。